я понимаю, что можно вставить обычную картинку в html, можно даже где-то завести хостинг для хранения флешек с трёхмерными картинками. Но это будет выглядеть убого в маленьком и невзрачном балуне, который нам предоставляет яндекс.
Но почему бы не воспользоваться уже накопленным опытом: отдельным слоем показывать Яндекс.Панорамы на НЯК?

И почему бы не предоставлять пользователям удобную возможность вставлять и дополнять этими картинками карту?

Вот так это делает яндекс: http://company.yandex.ru/technology/panoramas/

Замечу, после статьи создаётся впечатление, что такие фотографии возможно сделать только с использованием проф оборудования, но это не так: попробуйте ввести в поисковике например панорамы своими руками

Также помогут советы от самоучки. Тем кто хорошо научится советую дополнить вики статью: http://ru.wikipedia.org/wiki/Панорамная_фотография">Панорамная фотография.