весь сбор информации на Народной карте ориентирован прежде всего на пользователей, которые будут эти данные использовать в геосервисах Яндекса, а не осуществляется сам по себе, ради процесса.
И введение обсуждаемого флажка - также было шагом в эту сторону. 
Говорить об "официальности" применительно к населённым пунктам или районам города - легко. Тут статус территории влияет на многие экономические и управленческие вопросы и чётко зафиксирован в подавляющем большинстве случаев. А вот если речь идет о кварталах и микрорайонах - то ситуация другая, изначально эти образования преимущественно происходят из строительных и планировочных документов, а в реальной жизни используются для ориентирования и в названиях (например, остановок транспорта). А наличие в реестрах - очень сильно зависит от конкретного региона, а не отражает реальные различия в формате таких образований. 
Потому на текущий момент мы не видим практического смысла в выставлении флажка у кварталов и микрорайонов, поскольку на карте хотим их показывать одинаково, безотносительно наличия в реестре. 
А вот отделить на карте жилые комплексы - хотим, это сделает использование сервисов Яндекса более удобным для пользователей.

Дабы избежать споров, можно просто у категории "Квартал" флаг "Не имеет официального статуса" переименовать в "Является ЖК" или что-то в этом роде. И все будут довольны) А то, действительно, отображение названий ЖК целесообразно лишь на крупных масштабах, где они могут выступать хорошими ориентирами, а не как сейчас, когда их можно спутать с микрорайонами.

Во-во название галки просто смущает. Если на него не обращать внимание, то надо воспринимать ее как просто галку "понизить приоритет отображения", и официальность тут не причем.