Скажите, чем руководствуется робот, проставляя скорости 60 (как в населенном пункте) для дорог, которые не проходят в населенном пункте? (ссылки по клику).

Речь идет про федеральныеи и региональные трассы - их специально обосабливают от населенных пунктов. Но если робот так проставляет скорость, то в Я.Навигаторе будет много ложных срабатываний о превышении скорости.