В сентябре климат в Благоевграде можно охарактеризовать как теплый. Средняя температура днём в сентябре 18 градусов тепла. В среднем в сентябре в Благоевграде 18 ясных, 7 дождливых и 5 дней с переменной облачностью. Дожди преимущественно умеренные.