В сентябре климат в Кышике можно охарактеризовать как холодный. Средняя температура днём в сентябре 10 градусов тепла. В среднем в сентябре в Кышике 16 дождливых, 13 пасмурных и 1 ясный день. Дожди преимущественно умеренные. В сентябре, а также в январе, феврале, апреле и октябре Кышик cчитается местом, некомфортным для посещения.