В сентябре климат в Малом Жемчуге можно охарактеризовать как теплый. Средняя температура днём в сентябре 11 градусов тепла. В среднем в сентябре в Малом Жемчуге 18 ясных, 9 с переменной облачностью и 3 дождливых дня. Дожди преимущественно слабые.