Если супруги получают вычет по ипотеке, то они составляют заявление о распределении вычета. В нем указывается, какая сумма идет супруге, а какая супругу.
Поэтому в декларации 3-НДФЛ каждый отчитывается "за себя": указывает СВОЮ сумму уплаченных процентов за все года, а также СВОИ суммы по прошлым периодам, которые уже были возвращены.