В целом уточненный расчет заполняется в соответствии с Письмом ФНС России от 28.06.2017 N БС-4-11/12446@ "О представлении уточненных расчетов". В данном случае Вы заполняете раздел 3 по тому сотруднику, в данных по которому выявлены несоответствия, обратите внимание, что разделы 3.1 и 3.2 заполняются дважды: первый раз с первоначальными данными и 0 в строках 190-300, второй раз с новыми данными.