Конечно арестует. Работа у него такая. Пока есть исполнительное производство, будут применяться меры принудительного исполнения, в том числе аресты банковских счетов.
Это значит по второму долгу пристав будет использовать те же самые средства для исполнения, в том числе арест счетов.