Естественно, везти серебро и золото в больших объёмах было наиболее выгодно в том плане, что вы сразу же получаете деньги. Но во-первых, что тут значит "из Америки" — в XVII веке драгметаллы масштабно добывали на весьма небольшом проценте территории Нового Света. И все они были под контролем испанцев. Кроме того, испанцы за счёт этого серебра (80% добываемых ими драгметаллов были серебром) вели из Мексики торговлю с Китаем, получая таким образом ценные азиатские товары — которые уже могли быть отправлены в Европу.
Вне этих территорий вопрос "что выгоднее везти" вообще не стоял: что есть, то и везём. Хотя учитывая, что строительство рудников, организация производства на них, создание за океаном монетных дворов, снаряжение "серебряных флотов", строительство укреплений и охрана всего этого стоили Испании огромных денег и огромных людских ресурсов... Знаете, ещё вопрос, не выгоднее ли чем-то пушной промысел во французских колониях на месте нынешней Канады.
Североамериканские английские колонии в XVII веке вообще были более ценны как место, куда уезжают всякие недовольные типа пуритан и квакеров — хотя табак там уже успешно производили, конечно.
Опять же, выгодная штука — карибский сахарный тростник. Ну а пряности — это с основном история про южную Азию.