У меня есть 3 точки (3 адреса), могу ли я завести для редактирования только 1 карточку в Яндекс.Картах, а не делать 3 разные?

Для начала все же придется создать 3 организации (а также подтвердить права владельца на них), а затем их можно будет объединить в сеть. Более подробно об ограничениях можно прочитать здесь. Там же будет ссылка на форму для связи филиалов в сеть.