Служба в Армии обороны Израиля на данный момент не освобождает от призыва в Вооружённые силы РФ (в Интернете могут находиться иные сведения, но они относятся к периоду до 1 августа 2013 года, когда вступили в силу поправки к ФЗ "О воинской обязанности и военной службе"). По нынешним российским законам, для того, чтобы служба в армии другого государства "зачитывалась" в России, необходимо заключение договора между двумя странами. Россия и Израиль пока такой договор не заключили, но в октябре 2017 года была новость, что две страны "добились прогресса".
Кроме того, важно учитывать, что Россия не проводит призыв за рубежом. Если Вы постоянно проживаете за пределами РФ, то не обязаны состоять на воинском учёте (ст. 8 ФЗ "О воинской обязанности и военной службе"), а если выезжаете за рубеж на ПМЖ, то обязаны с него сняться. Поэтому, если Вы постоянно проживаете в Израиле или любой другой стране мира, то у Вас не должно возникнуть проблем при кратковременном - до 90 дней - посещении России даже в период призыва (с 1 апреля по 15 июля и с 1 октября по 31 декабря) - военкомат про Вас в любом случае не знает. Доказательством постоянного проживания за рубежом является снятие с миграционного учёта в России и постановка на консульский учёт в российском диппредставительстве.
В остальном зависит от того, какие проблемы Вы имеете в виду. Служба в вооружённых силах иностранного государства в России законом не запрещена (есть статья за наёмничество, но это совсем другое).