Как убрать из автооглавления один из уровней заголовков, но оставить стиль заголовка для навигации по файлу Word?

Выбираете "Ссылки" - "Оглавление" - "Настраиваемое оглавление" - "Параметры".

В списке доступных стилей убираете значения уровня у тех, которые не надо включать в оглавление. Нажимаете "ОК".

После этого в оглавление будут включены только те стили заголовков, которые вы оставили отмеченными в окне "Параметры оглавления". Но возможность навигации по документу с использованием этих заголовков сохранится.

Чтобы убрать из оглавления конкретные разделы, надо выделить название раздела, нажать на «Добавить текст» и выбрать пункт «Не включать в оглавление». Далее обновить оглавление и данные разделы не будут включены.