Чихуахуа болеют всеми теми же болезнями. что и все остальные собаки.
Это бешенство, чума, энтерит, парвовироз и пр. Чихи так же как и остальные собаки подвержены заболеваниям ушей, глаз, костей и кожи.
Из болезней, которые присущи этой породе можно назвать частые проблемы с глазками, с дыханием - морда чиха короткая, он часто закашливается при возбуждении, как будто не хватает воздуха. Не редко среди чихов встречаются эпилептики.