Вот вам отличный маршрут - Юсуповский сад со стороны Садовой, двориком выходите на Фонтанку, переходите мост, идёте через сад Говорова, потом сворачиваете в Измайловский сад (обязательно посмотреть Петербургского ангела на скамейке) и заканчиваете в Польском саду усадьбы Державина и чудесном уютном кафе в оранжерее там же.
Набережная реки Пряжки достаточно малоизвестное место, но очень симпатичное. А вообще в Петербурге нужно просто удалиться на пару кварталов в сторону от основных улиц, и уже хорошо и спокойно гуляется. Это применимо и к Петроградке, и к Ваське, и к Чернышевской, и к Коломне.
В Санкт-Петербурге существуют такие тихие, относительно безлюдные и симпатичные места, как кладбища. Все прочие места в Санкт-Петербурге - шумные, многолюдные и неприглядные.
Что меня всегда поражало в Петербурге: стоит свернуть на перпендикулярную Невскому улицу - сразу пропадает ощущение нахождения в Мегаполисе. Походите по маленьким улочкам недалеко от м.Владимирская, около Большого государственного цирка, вдоль Фонтанки. Очень здорово работает принцип "куда глаза глядят" - поверьте, не потеряетесь :)
Мозаичный дворик на чайковского. Пешком от Сенной по Каналу Грибоедова к Никольскому собору, противоположная от Мариинки улица Декабристов и прилегающие к ней. Улица Римского Корсакова.