Для симуляции аэродинамики есть Autodesk Falcon и HyperWorks Virtual Wind Tunnel. Если интересует симуляция аэродинамики реальных летательных аппаратов в приближенных к реальным условиях, то авиасимулятор X-Plane имеет функционал, позволяющий добавлять и глубоко настраивать летательные аппараты. Реализация физики полёта на всех режимах (реактивный полёт, винтовая тяга, полёт без включенного мотора) признаётся очень качественной. В случае заинтересованности в проработанной симуляция гравитации в контексте космических полётов с чисто символической аэродинамикой, посмотрите в сторону KSP RO/RP-1/RSS/Principia, где через моды также можно добавлять собственные объекты. Примером высокоточной симуляции гравитации и некоторых иных астрофизических явлений без учёта аэродинамики является Universe Sandbox.