Объяснить однозначно стоит.
Но не вступать в прения.
С того момента, как вы приступите к заказу, вы автоматически становитесь соучастником.
И желательно (перед тем как вы приступите к работе) подписать договор, в котором необходимо прописать вашу часть работы, требования клиента, предоставленные клиентом исходники (или их отсутствие) и ответственность за результат и права владения им.