Ответов на этот вопрос множество и они не исчерпываются тремя предложенными. Ну, во- первых, и это самое элементарное, бисер кончился. Во-вторых, и это самое невероятное, свиньи вдруг превратились в разумных и грамотных людей. В-третьих, и это самое лучшее, свиней нет, разбежались. Я еще не беру такой, неприятный, вариант, когда Фоме неверующему отрезали пальцы, чтобы он не мог «вложить персты в раны». (Хотя иногда этого очень хочется проделать, особенно с языком - тогда и вопросов не будет). А иногда, это просто обычная лень - совать руку в карман, совершать какие то телодвижения, в результате которых совершенно не уверен.
Ну и, конечно, есть и такой вариант, что бисера и не было никогда.