Есть такая (шуточная) формулировка законов термодинамики:
1.Тепло можно превратить в работу. 2Лучше всего это делать при Т=0К 3.Абсолютный "0" недостижим.
Чуть серёзнее. Третье начало: "При стремлении температуры любой равновесной термодинамической системы к абсолютному нулю ее энтропия стремится к некоторой универсальной постоянной величине, значение которой не зависит от каких-либо термодинамических параметров системы". А энтропия это просто логарифм числа состояний системы.
Атомы при 0К теряют кинетическую энергию, просто потому, что температура это и есть средняя кинетическая энергия хаотического движения. Если атомы собраны в твёрдое/жидкое тело, то амплитуда их колебаний уменьшается, но не до 0, остаются так называемые нулевые колебания (из-за неопределенности Гейзенберга).
Про влияние Т=0 на нейтроны,электроны,протоны в составе атома ничего не слышал.
На всякий случай. Получение низких температур занятие времязатратное. Чтобы охладить макроскопический объём до 10мК уходит порядка суток (рефрижератор растворения), до 2-3 мК - ближе к рабочей неделе (последняя ступень - парамагнитное размагничивание). Дальше очень мешают машины (колебания почвы даже если установка на спец.фундаменте).