В мясе содержится много различных белков. При варке основаная их часть остается внутри куска, а какая-то часть выходит наружу и становятся часьтю бульона. Причем при повышении температуры некоторые белки разрушаются, некоторые коагулируют (сворачиваются). Так вот часть вышедших в воду и свернувшихся белков, которые нерастворимы в воде и образуют пену. Из бульона мы эту пену убираем в основном из эстетических соображений. Сейчас вполне себе сытые времена, и можно себе позволить выкинуть часть белков, ради красивого прозрачного бульона.