Всё просто.
Раз - очень далеко до аэродромов, способных принять пассажирский самолёт на аварийную посадку.
Два - проблемы с навигацией в районе полюса. Компаса глючат, спутники дают неточные данные.
Три - холодно, топливо может подмерзать на высоте.
Насчёт подмерзания топлива - полный бред
Летают, когда это кратчайший маршрут. Например, когда авиакомпании не могли или не хотели платить за пролёт по Транссибирской магистрали над СССР, они летали из Европы в Японию и Корею через Северный полюс с посадкой в Анкоридже. Первой была SAS в феврале 1957 года.
Сейчас через полюс летают из Азии в США и Канаду.