Зависит от траектории. Если разгонять аппарат для полета сразу от Земли до Юпитера, то 1.5--2 года. Однако ученые предпочитают тратить меньше топлива и для разгона использовать гравитационные маневры. Снижение запасов топлива увеличивает полезную нагрузку, но и время полета. Например, аппарат juno добирался до юпитера пять лет, а планируемый к запуску в 2022м аппарат JUICY -- и вовсе девять.
Это на практике. В теории, даже используя современные химические двигатели, можно было бы запустить в космос многоступенчатую ракету, дозаправить на орбите и долететь до юпитера быстрее, чем за год. Это было бы очень-очень дорого и совершенно бесмысленно, никто подобного делать не станет.