Смотря что вы подразумеваете под "пустым пространством". Если имеется в виду некая область, где нет галактик, звезд, планет, и других объектов, то такая область есть. Войд Волопаса - область диаметром примерно 300 млн световых лет. Есть ли в этой области материя, частицы, или то чего мы не знаем - неизвестно.
А если имеется в иду совсем пустота, в которой нет даже пустоты, то могу предположить, что подобное есть за пределами расширяющиеся Вселенной.