В сентябре климат в Нукусе можно охарактеризовать как теплый. Средняя температура днём в сентябре 27 градусов тепла. В среднем в сентябре в Нукусе 30 ясных дней. В сентябре, а также в апреле Нукус cчитается местом, комфортным для посещения.