В июне климат в Чилакапе можно охарактеризовать как жаркий. Средняя температура днём в июне 28 градусов тепла. В среднем в июне в Чилакапе 22 дождливых, 6 ясных, 1 пасмурный и 1 день с переменной облачностью. Дожди преимущественно сильные. В июне, а также в январе, феврале, марте и апреле Чилакап cчитается местом, некомфортным для посещения.