В сентябре климат в Зее можно охарактеризовать как теплый. Средняя температура днём в сентябре 13 градусов тепла. В среднем в сентябре в Зее 14 дней с переменной облачностью, 11 ясных и 5 дождливых дней. Дожди преимущественно слабые.