В сентябре климат в Якты-Куле можно охарактеризовать как теплый. Средняя температура днём в сентябре 14 градусов тепла. В среднем в сентябре в Якты-Куле 10 дней с переменной облачностью, 7 дождливых, 7 ясных и 6 пасмурных дней. Дожди преимущественно слабые.