В сентябре климат в Большом Кугунуре можно охарактеризовать как теплый. Средняя температура днём в сентябре 13 градусов тепла. В среднем в сентябре в Большом Кугунуре 17 дождливых, 10 пасмурных, 2 ясных и 1 день с переменной облачностью. Дожди преимущественно умеренные. В сентябре, а также в январе, апреле и октябре Большой Кугунур cчитается местом, некомфортным для посещения.