В сентябре климат в Канаконе можно охарактеризовать как теплый. Средняя температура днём в сентябре 27 градусов тепла. В среднем в сентябре в Канаконе 29 дождливых и 1 ясный день. Дожди преимущественно сильные. В сентябре, а также в июне, июле, августе и октябре Канакона cчитается местом, некомфортным для посещения.