В сентябре климат в Чечуйске можно охарактеризовать как холодный. Средняя температура днём в сентябре 8 градусов тепла. В среднем в сентябре в Чечуйске 17 дождливых, 7 пасмурных, 4 ясных и 2 дня с переменной облачностью. Дожди преимущественно умеренные. В сентябре, а также в январе, феврале, апреле и мае Чечуйск cчитается местом, некомфортным для посещения.