В сентябре климат в Деггендорфе можно охарактеризовать как теплый. Средняя температура днём в сентябре 17 градусов тепла. В среднем в сентябре в Деггендорфе 12 ясных, 11 с переменной облачностью, 6 дождливых и 1 пасмурный день. Дожди преимущественно слабые.