В сентябре климат в Гиагинской можно охарактеризовать как теплый. Средняя температура днём в сентябре 24 градуса тепла. В среднем в сентябре в Гиагинской 19 ясных, 6 дождливых и 5 дней с переменной облачностью. Дожди преимущественно сильные. В сентябре, а также в августе Гиагинская cчитается местом, комфортным для посещения.