В июне климат в Иштуганове можно охарактеризовать как теплый. Средняя температура днём в июне 22 градуса тепла. В среднем в июне в Иштуганове 13 ясных, 12 дождливых и 5 дней с переменной облачностью. Дожди преимущественно сильные.