В сентябре климат в Чоныпе можно охарактеризовать как теплый. Средняя температура днём в сентябре 24 градуса тепла. В среднем в сентябре в Чоныпе 14 ясных, 10 с переменной облачностью и 6 дождливых дней. Дожди преимущественно сильные.