В сентябре климат в Кхлонг-Яй можно охарактеризовать как теплый. Средняя температура днём в сентябре 27 градусов тепла. В среднем в сентябре в Кхлонг-Яй 30 дождливых дней. Дожди преимущественно сильные. В сентябре, а также в апреле, мае, июне и июле Кхлонг-Яй cчитается местом, некомфортным для посещения.