В сентябре климат в Хойто-Голе можно охарактеризовать как холодный. Средняя температура днём в сентябре 7 градусов тепла. В среднем в сентябре в Хойто-Голе 15 дней с переменной облачностью, 11 ясных и 4 дождливых дня. Дожди преимущественно слабые.