В сентябре климат в Кусацу можно охарактеризовать как теплый. Средняя температура днём в сентябре 19 градусов тепла. В среднем в сентябре в Кусацу 22 дождливых, 5 ясных и 3 пасмурных дня. Дожди преимущественно сильные. В сентябре, а также в марте, апреле, июне и июле Кусацу cчитается местом, некомфортным для посещения.