В июне климат в Кызылкайрате можно охарактеризовать как теплый. Средняя температура днём в июне 16 градусов тепла. В среднем в июне в Кызылкайрате 20 дождливых, 6 ясных и 4 дня с переменной облачностью. Дожди преимущественно сильные. В июне, а также в марте, апреле, мае и октябре Кызылкайрат cчитается местом, некомфортным для посещения.