В июне климат в Лашкуте можно охарактеризовать как теплый. Средняя температура днём в июне 14 градусов тепла. В среднем в июне в Лашкуте 24 дождливых и 6 ясных дней. Дожди преимущественно сильные. В июне, а также в марте, апреле, мае и июле Лашкута cчитается местом, некомфортным для посещения.