В сентябре климат в Мышкаре можно охарактеризовать как теплый. Средняя температура днём в сентябре 16 градусов тепла. В среднем в сентябре в Мышкаре 11 дней с переменной облачностью, 7 дождливых, 7 ясных и 5 пасмурных дней. Дожди преимущественно умеренные.