В апреле климат в Нелькане можно охарактеризовать как морозный. Средняя температура днём в апреле 2 градуса мороза. В среднем в апреле в Нелькане 14 пасмурных, 9 со снегом и 7 дождливых дней. Снегопады преимущественно слабые.