Средняя температура днём в сентябре 9 градусов тепла. В среднем в сентябре в Нестерове 18 дождливых, 8 ясных, 3 с переменной облачностью и 1 пасмурный день. Дожди преимущественно сильные. В сентябре, а также в январе, феврале, апреле и мае Нестерово cчитается местом, некомфортным для посещения.