В июне климат Ногайбае можно охарактеризовать как теплый. Средняя температура днём в июне 22 градуса тепла. В среднем в июне Ногайбае 12 дней с переменной облачностью, 11 ясных и 7 дождливых дней. Дожди преимущественно слабые. В июне, а также в августе Ногайбай cчитается местом, комфортным для посещения.