В сентябре климат в Новоишимском можно охарактеризовать как теплый. Средняя температура днём в сентябре 16 градусов тепла. В среднем в сентябре в Новоишимском 12 дней с переменной облачностью, 8 ясных, 5 дождливых и 5 пасмурных дней. Дожди преимущественно слабые.