В июне климат в Падозеро можно охарактеризовать как теплый. Средняя температура днём в июне 17 градусов тепла. В среднем в июне в Падозеро 14 дождливых, 8 с переменной облачностью, 5 ясных и 3 пасмурных дня. Дожди преимущественно умеренные.