В сентябре климат в Подойниково можно охарактеризовать как теплый. Средняя температура днём в сентябре 14 градусов тепла. В среднем в сентябре в Подойниково 13 дней с переменной облачностью, 8 дождливых, 7 ясных и 2 пасмурных дня. Дожди преимущественно слабые.