В сентябре климат в Пудоже можно охарактеризовать как теплый. Средняя температура днём в сентябре 12 градусов тепла. В среднем в сентябре в Пудоже 19 дождливых, 7 пасмурных, 3 ясных и 1 день с переменной облачностью. Дожди преимущественно умеренные. В сентябре, а также в апреле, октябре и ноябре Пудож cчитается местом, некомфортным для посещения.