В сентябре климат в Пугачеве можно охарактеризовать как теплый. Средняя температура днём в сентябре 15 градусов тепла. В среднем в сентябре в Пугачеве 9 дождливых, 9 с переменной облачностью, 7 ясных и 5 пасмурных дней. Дожди преимущественно слабые.