В июне климат в Рутуле можно охарактеризовать как теплый. Средняя температура днём в июне 12 градусов тепла. В среднем в июне в Рутуле 21 дождливый и 9 ясных дней. Дожди преимущественно сильные. В июне, а также в апреле, мае, сентябре и октябре Рутул cчитается местом, некомфортным для посещения.