В июне климат в Сан-Мигель-де-Альенде можно охарактеризовать как теплый. Средняя температура днём в июне 23 градуса тепла. В среднем в июне в Сан-Мигель-де-Альенде 18 дождливых, 6 ясных, 4 с переменной облачностью и 2 пасмурных дня. Дожди преимущественно сильные. В июне, а также в июле, августе и сентябре Сан-Мигель-де-Альенде cчитается местом, некомфортным для посещения.